本系原名為生物學系，於民國五十三年，由奧地利籍扈伯爾神父負責籌辦，並擔任首任系主任，扈伯爾神父積極向國外募款，購買生物實驗儀器與器材，推展生物相關研究。

扈神父於民國七十年退休，民國七十一年由第一屆系友劉寶偉老師接任系主任，延續系務的發展；七十七年則由第四屆系友楊美桂老師主持系務，八十三年由陳擎霞老師接任，八十九學年度起由第十屆曾婉芳老師接任，九十學年度起由崔文慧老師接任，九十六學年度起由李永安老師接任。

本系自民國九十年八月一日起，由生物學系更名為生命科學系。

本系延聘生命科學各領域中，學有專精人士，擔任本系專任教師，教學及研究並重，並強調建立密切之師生關係，積極培育生物技術專業人才。 本系自扈伯爾神父籌建以來，一直具有下列特色：

• 教學與研究並重

• 密切之師生關係

• 優良師資

本校生物學學門及農業科學學門的研究表現在全國15名

依教育部高等教育評鑑中心96年5月發行「評鑑雙月刊」，在全國160多所公私立大學中，本校在「生物學學門」所發表的報告，「5年總引用次數」排名第12名。而在「農業科學學門」所發表的報告，「5年總篇數」排名第15名，而「5年總引用次數」則排名第14名。

本系畢業系友在學術領域具有優秀的表現，例如以下畢業系友：

本系所的系館位於本校理工學院耕莘樓的中間位置，為本系所之辦公室、教師實驗室、學生實驗室、及公用儀器室所在，在系館旁並設有動物房、植物溫室、及醱酵室等。本校為善加利用空間，學生上正課則在進修部教學大樓的教室上課。理工學院聖言樓內，設有電腦教室，可提供本系學生上電腦及統計等相關課程使用。